Sidekjeden i figuren går ut fra peptidkjeden. Den består av en rett kjede med fire $\mathrm{C}{\mathrm{H}}_2$-grupper og en aminogruppe ytterst: $\text{–}\mathrm{C}{\mathrm{H}}_2\text{–}\mathrm{C}{\mathrm{H}}_2\text{–}\mathrm{C}{\mathrm{H}}_2\text{–}\mathrm{C}{\mathrm{H}}_2\text{–}\mathrm{N}{\mathrm{H}}_2$. Det er sidekjeden til lysin (se aminosyretabellen i vedlegget, der den er protonert til $\text{–}\mathrm{N}{\mathrm{H}}_3^{+}$ ved pH 7,4).

Asparagin har sidekjeden $\text{–}\mathrm{C}{\mathrm{H}}_2\text{–}\mathrm{C}\mathrm{O}\mathrm{N}{\mathrm{H}}_2$ med en amidgruppe. Prolin har en ring der sidekjeden er bundet tilbake til aminogruppen. Glysin har bare et H-atom som sidekjede.