Under lysreaksjonene pumpes ${\mathrm{H}}^{+}$ inn i lumen, det innerste rommet i tylakoiden. Konsentrasjonen av ${\mathrm{H}}^{+}$ blir derfor høy inne i tylakoiden og lav i stroma utenfor. Ved diffusjon går ${\mathrm{H}}^{+}$ fra høy til lav konsentrasjon. ${\mathrm{H}}^{+}$ strømmer altså ut av tylakoiden gjennom ATP-syntase, og energien brukes til å lage ATP.

Figur 2 viser mange ${\mathrm{H}}^{+}$ inne i tylakoiden, få utenfor og en pil ut gjennom ATP-syntase.

• Figur 1 viser diffusjon innover fra høy konsentrasjon utenfor. Det er feil retning for en tylakoid.
• Figur 3 og figur 4 viser transport fra lav til høy konsentrasjon. Det er ikke diffusjon.