Ved en replikasjonsgaffel er de to trådene i den ikke-kopierte delen av DNA-et antiparallelle. Den kontinuerlige (ledende) tråden syntetiseres i retning $5^{\prime }\to 3^{\prime }$ med voksepunktet ($3^{\prime }$-enden) hele tiden helt ute ved selve gaffelen, mens den diskontinuerlige (hengende) tråden lages i korte biter (Okazaki-fragmenter) som starter nær gaffelen og vokser bort fra den. I figur 2 peker den lange, hele pilen mot gaffelen (voksepunktet ligger ved gaffelen, som for den ledende tråden), mens den korte, stiplede pilen peker bort fra gaffelen (som for et Okazaki-fragment), og $5^{\prime }$/$3^{\prime }$-merkingen langs pilene stemmer med at ny DNA-syntese alltid går fra $5^{\prime }$ til $3^{\prime }$.

I figur 1 er merkingen ombyttet: den lange pilen er merket som om syntesen går fra $3^{\prime }$ til $5^{\prime }$, som er umulig. I figur 3 og 4 peker den hele pilen bort fra gaffelen, som ikke passer med en kontinuerlig tråd som skal følge gaffelen.