Pil 4 peker inn i tylakoidrommet (lumen). I lysreaksjonene pumper elektrontransportkjeden i tylakoidmembranen ${\mathrm{H}}^{+}$-ioner fra stroma og inn i tylakoidrommet. Spaltingen av vann frigjør også ${\mathrm{H}}^{+}$ inne i tylakoidrommet. Konsentrasjonen av ${\mathrm{H}}^{+}$ øker derfor der. Ionene strømmer tilbake til stroma gjennom ATP-syntase, og da dannes ATP.

Pil 1 peker på membranene rundt kloroplasten. Pil 2 peker på stroma, der konsentrasjonen av ${\mathrm{H}}^{+}$ går ned. Pil 3 peker på tylakoidmembranen, der pumpene sitter, men ionene hoper seg opp på innsiden av membranen.