I nitrogenkretsløpet blir ammonium omdannet videre til nitritt og deretter til nitrat av nitrifiserende bakterier i jorda. Nitrat er den nitrogenformen som er mest stabil og lettest tilgjengelig i jordvæsken, og det er derfor den planterøttene fortrinnsvis tar opp. Aminosyrer (B) er byggesteiner planta selv lager av nitrogen den har tatt opp, nitritt (C) er bare et mellomtrinn i nitrifikasjonen, og nitrogengass (D) kan ikke utnyttes direkte av planter – bare enkelte nitrogenfikserende bakterier kan omdanne den.