Genflyt er utveksling av alleler mellom populasjoner, for eksempel når individer vandrer inn og formerer seg. Innvandrerne kan ha med seg alleler som populasjonen ikke hadde fra før. Genflyt øker derfor den genetiske variasjonen i populasjonen.

Flaskehalseffekt oppstår når en populasjon krymper kraftig, for eksempel etter en naturkatastrofe. De få overlevende har bare et tilfeldig utvalg av allelene. Mange alleler forsvinner, og den genetiske variasjonen blir mindre, også etter at populasjonen har vokst igjen.

Genflyt øker altså variasjonen, mens flaskehalseffekt reduserer den.