DNA-trådene er antiparallelle: de går i motsatt retning. I figur 1 er den ene tråden merket 5’ øverst og 3’ nederst, den andre 3’ øverst og 5’ nederst. Fosfatgruppen (sirkelen) sitter ved den ledige 5’-enden på begge trådene, slik det skal være, mens 3’-endene bare har en ledig OH-gruppe. Figur 2 har nøyaktig samme struktur tegnet, men 5’- og 3’-merkene er byttet om, slik at fosfatgruppen ligger ved det som er merket 3’. Figur 3 og figur 4 viser to tråder som går i samme retning (begge ender 5’ i figur 3, begge 3’ i figur 4) – det er parallelt, ikke antiparallelt, og dermed feil.